Pada awal berdirinya tanggal 1 April 1952 Universitas Krisnadwipayana berbentuk akademi dengan Akademi Hukum / Sosial di bawah pimpinan Mr. Soemarto Djojodihardjo. Atas desakan masyarakat dan mengingat minat calon-calon mahasiswa terhadap beberapa bidang ilmu pengetahuan, maka pada tanggal 1 Juli 1952 didirikanlah Fakultas Ekonomi di bawah pimpinan Prof. Dr. Ong Eng die. Dengan berdirinya Fakultas Ekonomi tersebut maka Akademi Hukum/Sosial diubah namanya menjadi Universitas Krisnadwipayana.Untuk menjamin kesinambungan universitas maka dibentuklah yayasan sebagai badan pembina dengan Akte Notaris Sie Khwan Djioe No. 134 tertanggal 29 Januari 1954 yang disebut Yayasan Universitas Krisnadwipayana.Selanjutnya, pada tanggal 20 September 1956 didirikan Fakultas Ilmu Tata Praja di bawah pimpinan Prof. Dr. Prajudi Atmosudirdja, S.H. Yang merupakan Fakultas Ilmu Tata Praja pertama di Indonesia (yang kemudian diganti namanya menjadi Fakultas Administrasi Negara dan Niaga), yang kini disebut Fakultas Ilmu Administrasi. Pada tahun 1963 didirikanlah Fakultas Teknik yang terdiri atas dua jurusan yakni Mesin dan Sipil, yang dipimpin oleh Ir. Widodo.Setelah 14 tahun berdiri, maka berdasarkan Surat Keputusan Menteri PTIP No. 39 Tahun 1966, Fakultas Hukum, Fakultas Ekonomi, Fakultas Administrasi Negara dan Niaga diberi pengakuan oleh pemerintah dengan status “disamakan” dengan universitas negeri baik untuk gelar Sarjana Muda maupun untuk Sarjana Lengkap. Dengan demikian ujian-ujian untuk mencapai gelar Sarjana Lengkap bagi ketiga fakultas tersebut dapat dilaksanakan oleh Universitas Krisnadwipayana tanpa pengawasan pemerintah. Untuk Fakultas Teknik saat sekarang ini sudah berstatus terakreditasi.